Что такое «дельта» -штамм и нужно ли его бояться? Разбираемся, что происходит с мутациями коронавируса

Что такое вирусы, вызывающие беспокойство? Почему штамм дельта вдвое более заразный, чем остальные мутации? Где отлеживать данные про распространению новых штаммов? По просьбе Правила жизни разбирается Елена Савинова, автор блога «О прививках без истерик», соучредительница АНО по развитию и поддержке вакцинопрофилактики «Коллективный иммунитет».
Что такое «дельта» -штамм и нужно ли его бояться? Разбираемся, что происходит с мутациями коронавируса

Вирусы меняются, и в том числе SARS-CoV-2. Коронавирус имеет низкую изменчивость, но некоторые из значимых изменений могут привести к тому, что вирус поменяет свои свойства и станет, например, более заразным. Другие изменения повлияют на тяжесть заболевания, третьи — на эффективность вакцин и так далее.

РЕКЛАМА – ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ

За мутациями коронавируса следят ученые во всем мире (например, в системе GISAID). Также Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) собирает и анализирует эту информацию. В конце 2020 года среди штаммов вируса стали выделять так называемые варианты, представляющие интерес (variants of interest, VOIs), и варианты, вызывающие беспокойство (variants of concern, VOCs).

Раньше в СМИ и в обиходе использовалась либо научная номенклатура для названия вариантов (которая представляет собой сочетание букв и цифр), либо наименование по стране, где впервые был обнаружен тот или иной вариант. Но ВОЗ считает наименование по стране дискриминирующим, поэтому с июня для названия различных вариантов вне научной среды используют буквы греческого алфавита — «альфа», «бета», «гамма», «дельта» и так далее.

Что такое варианты, представляющие интерес, и варианты, вызывающие беспокойство?

Вариант, представляющий интерес (VOI), — это вирус, у которого произошли такие изменения в геноме, что они влияют на ключевые параметры: заразность, тяжесть течения ковида, ускользание от иммунного ответа, ускользание от диагностики или лечения. Чтобы какой-то вариант вируса назвали представляющим интерес, нужно еще несколько условий:

РЕКЛАМА – ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ

— в разных странах уже должны быть зафиксированы случаи высокого уровня передачи этого варианта в сообществах;

— также должно расти число случаев с этим вариантом — как абсолютное, так и относительное (когда сравнивают между собой разные варианты коронавируса).

Вариант, вызывающий беспокойство (VOC), во-первых, отвечает всем условиям, которые выдвигаются для варианта, представляющего интерес. Также для этого варианта обязательно одно из трех:

  • повышенная заразность или неблагоприятные изменения в эпидемиологической характеристике ковида;
  • повышенная вирулентность* или изменения в клинических проявлениях заболевания;
  • сниженная эффективность противоэпидемических мер, диагностики, вакцин или лечения.

(*Вирулентность — это такая характеристика, которая показывает, насколько тяжело протекает заболевание у тех, у кого есть симптомы этого заболевания. Вирулентность — это отношение числа серьезных или смертельных случаев к общему числу случаев с клинической картиной заболевания.)

РЕКЛАМА – ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ
РЕКЛАМА – ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ

Также ВОЗ создала список для мониторинга тех вариантов, которые пока нельзя включить по критериям ни в список тех, что вызывают беспокойство, ни в список тех, что вызывают интерес. В списке для мониторинга оказываются варианты, которые могут представлять риск в будущем. Буквы греческого алфавита в списке для мониторинга не задаются — для этих вариантов используется лишь научная номенклатура.

В начале июля появились новости о том, что в списке для мониторинга, где числятся двенадцать вариантов, оказался и вариант AT.1, который впервые был обнаружен в России в январе 2021 года.

Какие варианты есть в России?

Отслеживать различные варианты в России можно на сайте taxameter.ru, который создан лабораторией Георгия Базыкина (Сколтех и ИППИ РАН) совместно с Российским консорциумом по секвенированию геномов коронавируса (CORGI). Большая часть открытых данных о геномах коронавируса — это данные для Санкт-Петербурга.

Впрочем, как отмечают сами создатели карты, геномы коронавируса изучаются в России мало, и различные варианты попадают в базу данных с разной вероятностью, поэтому, к сожалению, нельзя сказать, что на сайте дана представительная выборка. На официальном сайте НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора с информацией о геномах вирусов данных в открытом доступе нет, поэтому говорить об открытых государственных данных не приходится.

РЕКЛАМА – ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ

Вариант «дельта»

Первые образцы варианта «дельта» были впервые обнаружены в Индии в октябре 2020 года. Этот вирус был ответственен за весеннюю катастрофу в Индии, когда, только по официальным данным с 8 марта по 15 июля 2021 года, умерло 254 233 человека (а вообще эксперты говорят о том, что данные о заболеваемости и смертности в Индии занижаются). При этом за все время с начала пандемии до 7 марта в Индии умерло 157 756 человек, то есть за прошедшие четыре месяца от ковида в Индии умерло на 60% больше людей, чем за все время до этого.

Вариант «дельта» появился в Индии и распространился в Европе, Северной Америке, Австралии, а также в Африке и Южной Америке. В России первый образец был зарегистрирован 7 апреля. В предыдущем материале мы приводили официальную российскую статистику по заболеваемости ковидом и смертности от него, что позволяет говорить о новом значительном подъеме.

По британским данным, индекс репродукции (показатель заразности) для тех людей, у которых нет иммунитета к коронавирусу, у штамма «дельта» составляет от 3,3 до 10 (нам неизвестны такие данные для России). А в актуальной версии британского плана действий в ближайшее время предусмотрено три сценария развития событий: когда индекс репродукции после снятия ограничений будет равен 5,5 (средний), 4,5 (низкий) или 7 (высокий).

В целом штамм «дельта» вдвое более заразный, чем другие варианты, не относящиеся к числу вызывающих беспокойство или представляющих интерес. Судя по препринту британского исследования — предварительной версии научной публикации, которая еще не прошла рецензию, — вариант «дельта» менее чувствителен к нейтрализующим антителам (тем, что связываются с вирусом и не дают ему проникнуть в клетки) у тех, кто уже перенес инфекцию ранее.

РЕКЛАМА – ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ

Также вариант «дельта» лучше других вариантов реплицируется (размножается) в клетках дыхательных путей, что может вызвать более сильную инфекцию. Кроме того, в этом и другом препринте говорится о том, что варианту «дельта» легче проникать в клетки человека. Это связано с тем, что в S-белке варианта «дельта» произошла мутация, которая облегчает его разрезание. Наконец, именно вариант «дельта» отвечал за большую часть инфекций прорыва (тех инфекций, которые случились, несмотря на вакцинацию) у медицинских работников в двух больницах в Дели, где занято полторы тысячи человек.

РЕКЛАМА – ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ

Выводы

Из тех вариантов коронавируса, что присутствуют в России и относятся к числу вызывающих беспокойство, варианты «альфа» и «бета» имеют похожие эффективные индексы репродукции (показатели заразности). Однако оба они, включая также варианты, представляющие интерес, «эта» и «йота», примерно на 25–35% более заразны, чем остальные варианты коронавируса. А вариант «дельта», о котором мы рассказывали в предыдущем материале, и вовсе вдвое заразнее, чем варианты коронавируса, не относящиеся к числу вызывающих беспокойство или представляющих интерес.

В статье, опубликованной в «Международном журнале инфекционных заболеваний» (International Journal of Infectious Diseases), посвященной включению прививок от ковида в программу вакцинации детей, говорится: «Появление вариантов, вызывающих беспокойство, происходит благодаря циркуляции вирусов в людях, не имеющих иммунитета к коронавирусу, и давлению отбора со стороны иммунитета у людей, которые перенесли инфекцию раньше или привились. Следовательно, снижение числа резервуаров для вируса будет ключевым моментом, чтобы снизить способность вируса мутировать».